Archive for enero 2009
ONCE
Tengo la manía de tener mi «Top Five» de casi todo, como Rob Gordon (el John Cushack de Alta Fidelidad). Anoche inesperadamente, ONCE se metió en mi Top 5 de películas relacionadas directamente con la música, haciéndose hueco entre «Casi Famosos«, «Alta Fidelidad» y»Empire Records«. Es de lo más recomendable que he visto en mucho tiempo, así que si tienen un huequecito en todo el fin de semana, yo no lo dudaría…
La película es a la vez su banda sonora, y por si os pica la curiosidad de primeras, aquí el trailer, y aquí una de sus mejores canciones (que podía ser cualquiera )
Ya me daréis las gracias…
Inteligencia Molecular: Listeria Monocytogenes
Hoy un «remake» de una antigua entrada esta vez para el Museo de la Ciencia, que también cuelgo en casa, y es que en su momento no tuve tiempo de desarrollarla en condiciones y merece muy mucho la pena.
Imagen Extraída de Wikipedia
Pasar desapercibido es un gran objetivo de todo patógeno. Llegar a las primeras células así como partir de ellas para infectar otras cercanas, supone un riesgo enorme, ya que en «campo abierto» son blanco fácil para el siempre atento sistema inmunológico. Intentar sortearlo exige pulir la estrategia, diseñar mecanismos sofisticados para tomar las riendas de un organismo sin ser visto.
Listeria es una bacteria gram positiva, que ha sido aislada asociada a enfermedades en peces, aves y mamíferos, pero que produce raramente enfermedad en humanos (prácticamente sólo en aquellos que trabajan con animales). Se transmite por la ingestión de alimentos, sobre todo leche y derivados lácteos, así como en verduras consumidas en crudo sin antes haberse desinfectado. La bacteria es capaz de colonizar múltiples órganos, tales como el cerebro o membranas de la médula espinal así como el torrente sanguíneo y es capaz de transmitirse al feto en embarazadas y en relaciones sexuales.
No voy a entrar en los detalles médicos (que dan para otro artículo) vamos directamente a sumergirnos en los detalles moleculares, donde la bacteria se ha ganado el artículo, ya que de entre todos los mecanismos de infección que leo y colecciono desde hace tiempo, el de Listeria Monocytogenes es uno de los más interesantes e impactantes que puedo enseñaros.
En este caso concreto lo más llamativo no es su entrada en la primera célula a colonizar, sino su salida, que conlleva la entrada en las siguientes células del organismo, sin salir a campo abierto, sin tocar el medio extracelular.
Como muchos sabréis, nuestras células tienen un «esqueleto» llamado citoesqueleto que mantiene la forma celular, ayuda a anclar la célula y sirve como railes para el transporte intracelular de muchas sustancias.
Una de las fibras más importantes que forma dicho esqueleto son las fibras de actina. Estas fibras no son estáticas e inamovibles, sino todo lo contrario. Están compuestas de pequeñas subunidades que se ensamblan y se desensamblan según las necesidades celulares. Si por ejemplo la célula quiere fagocitar un cuerpo del medio, polimeriza más actina y produce fibras más largas para poder lanzar unos «brazos» que sean capaces de rodear el cuerpo en cuestión y las vuelve a despolimerizar para introducirlo en su interior.
La primera manipulación que consigue la bacteria de dichas fibras consiste en dejarse fagocitar, entrando así de forma pasiva en la primera célula de nuestro organismo.
La bacteria conoce la naturaleza de las fibras de actina y también se aprovecha de ellas para diseñar la fuga. El mecanismo consiste en romper las fibras: las devuelve a grandes cantidades de subunidades, y una vez está rodeada de ellas, las une rápidamente tras ella formando un cometa.
Así se convierte en un proyectil imparable que atravesará la membrana celular por un lateral y penetrará en la célula contigua de la misma forma.
Es una forma limpia de entrada a otras células, ya que en ningún momento es visible desde el espacio extracelular. Una vez en el interior de la célula contigua la bacteria seguirá dividiéndose activamente, desarrollando la infección, diseminándose por el organismo.
Por si acaso el dibujo no os es suficientemente aclarativo, os cuelgo un vídeo de estas bacterias infectando una célula en cultivo. Fijaos que salen como cohetes, pero como no hay otra célula al lado, dan media vuelta y siguen buscando (una pasada de vídeo del laboratorio de Thierot University of Stanford, CA. USA).
Recomendaciones de la Casa (II)
Llevo unas semanas recibiendo correos de personas recién llegadas al blog, que parecen estar encantadas con su contenido. Uno de los problemas de un blog es que rebuscar entre los contenidos es más complicado que en una web normal, y muchas entradas quedan en el olvido.
Para facilitaros la faena, que mejor que poneros las recomendaciones de la casa, para ayudaros a engancharos un poquito más a Sonicando.
En qué Consiste la Vacuna Española contra el VIH
La Revolución Verde…Fluorescente y su actualización en La Revolución Verde Fluorescente…de la Medusa al Nobel
Bruce Ivins y las Cartas con Anthrax
¿Cómo se Hace la Vacuna contra la Gripe?
Gracias por Eliminarlo de mi Memoria
Sobrevivir a la Rabia: el Método Milwaekee
Polémica I: Experimentación Animal
Y si queréis recurrir a las anteriores recomendaciones, pinchad aquí.
Gracias por mantener vivo este blog ¡¡
Un Laboratorio crea el Primer Reloj Genético
El hombre siempre ha tenido la necesidad de medir el paso del tiempo, quizás como una gran duda existencial o quizás porque sus propios genes se lo pedían. Y es que nadie es ajeno a los cambios que se producen en su organismo en función del tiempo, el ciclo circadiano es una realidad que nos mueve desde dentro.
Muchos son los científicos que se han preocupado en investigar cuáles son los mecanismos genéticos que hacen que nuestro cuerpo siga las agujas del reloj, y de entre la información obtenida, un grupo suizo se ha atrevido a utilizar lo conocido para generar el primer reloj genético. La biología sintética es así, obtiene información de cómo los organismos hacen determinadas cosas, para crearlas desde cero.
Y es que si siempre se ha dicho que sólo cuando se entiende un concepto se es capaz de explicarlo, sólo cuando se conocen las leyes que dominan un proceso se es capaz de diseñarlo desde cero.
Imagen Extraída de http://www.qualifis.com.br
Se ha empezado por algo sencillo, por un oscilador, el mismo mecanismo que controla nuestros ciclos de vigilia/sueño. El oscilador consiste en un conjunto de genes que se regula cíclicamente una vez introducido en un organismo. Se había conseguido diseñar un «circuito génico» para hacer osciladores en bacterias, pero nunca uno que funcionara en una red tan compleja como una célula de mamífero.
El grupo de Martin Fussenegger del Swiss Federal Institute of Technology en Basel, Suiza, ha conseguido un oscilador que produce la proteína verde fluorescente de forma intermitente en células de ovario de Hámster y mantiene los ciclos del oscilador por más de 20 horas.
La construcción cuenta con 3 genes, tTA, PIT y GFP (gen de la proteína verde fluorescente). Se empieza produciendo la proteína tTA que hace dos cosas, activa el gen de la GFP y el de la PIT; se produce fluorescencia. Una vez se produce PIT, dicha proteína inhibe al gen de la tTA hasta que no queda nada de dicha proteína. Sin tTA no hay producción de PIT por lo que llega un momento en el que tampoco hay PIT. En dicho momento el gen tTa dejará de estar inhibido y volverá a producir tTA que activará a PIT y GFP produciéndose fluorescencia de nuevo. (leérselo de nuevo, que es durito a la primera)
Así tenemos, desde fuera, fluorescencia intermitente, a un ritmo determinado por la distinta cantidad en el tiempo de las proteínas tTA y PIT.
Pero podemos alterar la oscilación. Si añadimos varios de estos circuitos juntos haremos más frecuente la oscilación, veremos más pulsos de fluorescencia en el mismo tiempo, si disminuímos la cantidad, lo enlenteceremos.
Obviamente el objetivo de regular una proteína como la proteína verde fluorescente no es otro sino poder seguir el proceso, y verificar que la teoría era cierta, que el oscilador funciona.
Cambiemos ahora el gen de la luciferasa y pongamos el de la insulina. Y fijemos el oscilador cada 6 horas. Cada 6 horas tendremos producción de insulina en nuestro organismo. Las aplicaciones terapéuticas para diabéticos no tendrían precio.
Ese es el futuro de los relojes genéticos, entenderlos y manipularlos para conseguir producir o liberar fármacos o proteínas terapéuticas. No interesa tener un cachivache que se mueva con el tiempo, sino un distribuidor de agentes terapéuticos regulado temporalmente.
Y aunque estamos aún lejos de poderlos usar, esta semana, el grupo de Fussenegger ha dado un buen empujón hacia el futuro de los relojes genéticos y con ello ha sumado un importante logro al interesante mundo de la biología sintética.
Hoy Salimos en Informe Semanal
Hola parroquia, hoy un mensajito de autobombo:
El laboratorio del menda sale en Informe Semanal, en un reportaje que por lo menos durará un poquito (no los 10 segundos de un telediario). Así que si queréis conocer los detalles de la vacuna y leerlo en texto os supo a poco, o queréis cotillear como es mi laboratorio y hacer una porra de quien será Sonicando de todos los que salen currando, espero que veáis hoy a las 21:40 la primera.
A ver si sale un «free add» que puse en mi poyata de SONICANDO.COM 😉
Actualizo; no salió mi cartelito, una lástima…Para los que os hayáis perdido el reportaje, gracias a Hel, aquí tenemos un link de la página de informe semanal.
Así que ya lo puede ver todo el mundo ¡¡
Plantilla para Abstracts
Sonicando gracias a PHDcomics, os ayuda a escribir el abstract de vuestro nuevo artículo:
… las gracias se las dáis a Jorge Cham, yo soy sólo un mandao…
CapSnatching: Decapitar al Mensajero (inteligencia molecular)
Cuando hace tiempo abría la sección de inteligencia molecular ya sabía que uno de los grandes protagonistas iba a ser el virus de la gripe. La historia de hoy es un reto divulgativo de los duros, pero si no despegáis los ojos, prometo no defraudar.
Si algo hemos aprendido de los virus son nuestras armas para defendernos de ellos. Es verlos destruir algo e inmediatamente asociarlo a defensa celular o cuando menos a respuesta frente a «daños externos».
En un espacio tan pequeño como es una única célula, un virus tiene que entrar de la forma más silenciosa posible y controlar todos los procesos celulares en su beneficio, para generar un alto número de progenie, y partir de ahí salir de dicha célula para infectar todas las que le sea posible.
Someter a una célula entera contando sólo con 10 genes, como es el caso de la gripe, es algo digno de admiración. Los mecanismos moleculares con los que el virus se adueña de una célula son tan inteligentes y retorcidos que inmediatamente se asocian con comportamientos dignos de la familia Corleone. Hoy sólo os voy a contar uno: el CapSnatching.
Para ello necesito que comprendáis el dogma central de la biología molecular, (no os vayáis que os veo, y es cortito) el mecanismo por el que funciona la vida en pequeñito. Es simplemente conocer el nexo que une un gen con una determinada proteína. Básicamente, en nuestro organismo, quien «corta el bacalao» son las proteínas. Son las que hacen casi todo; transportan cosas, rompen cosas, metabolizan cosas…todo lo hacen ellas. Y como no podía ser de otra manera, para producir proteínas, en las «fábricas» de proteínas, hay proteínas currando.
Las instrucciones para hacer una determinada proteína están en el ADN, en su gen. Una proteína especial, llamada Polimerasa, se encarga de «leer» el gen y traducirlo a otro tipo de información genética, los ARN mensajeros. Estos mensajeros entraran en millones de mini-fábricas de proteínas llamadas Ribosomas (hechos de proteínas) y en su interior el código del mensajero se traduce a aminoácidos, que son las subunidades que forman las proteínas. (Una asignatura de la carrera en un párrafo, facilito, no?)
Ahora lo interesante.
Resulta que para que un mensajero se traduzca en el ribosoma tiene que tener una estructura determinada, así evitamos que entre cualquier guarrería de fuera. Por lo tanto nuestra maquinaria se asegura de ponerle una cabeza «CAP» y una Cola. Estos dos «distintivos» serán necesario para que el mensaje del gen se haga proteína.
Los virus suelen cargar con algunas de sus proteínas, por lo menos para empezar la jugada, pero lo que está claro es que con su reducido tamaño y su reducido genoma necesitan utilizar los recursos celulares. Pensad que tienen que producir millones de viriones, y para eso necesitamos millones de proteínas, y suelen llegar con lo puesto. El virus de la gripe tiene su propio complejo de la polimerasa, pero sus mensajeros no tienen CAP.
No me sorprendería que el virus hubiera copiado el diseño del CAP y se las hubiera agenciado para pegárselo a sus propios mensajeros, pero no sería ni tán útil, sorprendente y malévolo como el mecanismo real.
Lo que hace la polimerasa viral es capturar mensajeros celulares «cortarles la cabeza» y unirlos a los virales.
Ahora la maquinaria de producción de proteínas no procesa información propia, sino la viral camuflada. El virus así hace sus «copias pirata» mientras que la célula no se puede defender, porque no puede sintetizar proteínas, ya que hay alguien eliminando todos sus mensajeros. Si la célula quiere mandar una señal de alerta, lo intentará intentando producir proteínas que alerten, pero la señal no se llegará a generar. Si nota que está siendo infectada intentará producir otro tipos de proteínas antivirales, pero tampoco podrá.
Decapitar a los mensajeros permite no solo piratear el sistema y someterlo a su control, sino que encima elimina grandes posibilidades de defensa. Acojona ¿eh?
Nota: Este es el tipo de mecanismos por el que hice esta sección del Blog, y es que hay mecanismos de los «bichejos» que te dejan boquiabierto, que pasan cada vez que tenemos una infección, y que la gente desconoce totalmente. Simplemente espero que os cause la misma admiración que a mí (sino más, que uno está tol día leyendo estas cosas) y que lo hayáis entendido, porque además os he colao conocimientos básicos de bioquímica a tutiplen.
Charlas y Productividad Académica (la viñeta)
Y es que hay mucha gente que no sabes como lo hace para contar SIEMPRE lo mismo…
(Sacado de PHDcomics)
Sonicando 